Nat Genet： 人类癌症中病毒地理分布

德国乳腺癌研究课题中心 Peter Lichter 团队最新研究课题探究了进化乳腺癌中病原的分布。日前《自然—遗传学》在线刊出了这一研究成果。

作为泛癌全部都是序列归纳联盟的一部分，该数据集库收集了 38 个类型的 2658 例乳腺癌样本的全部都是序列和一部分转录全部都是序列测序数据集，研究课题部门利用共识的方法，导入了 3 个独立数据集库用以系统地研究课题潜在的病原病原体。在 382 个序列和 68 个转录组数据集比较大都检测到了病原不存在。研究课题发现，已知的与相关的病原，如爱泼斯坦—巴尔病原（EBV）、乙型肝炎病原（HBV）和人瘤病原（HPV）的检出率都很较高。

这项研究课题阐释了腋下癌中 HPV 和驱动基因基因的值得注意排他性以及 HPV 与 APOBEC 基因形态的相关性，这声称抗病原防御能力下降是宫颈癌、胰脏和腋下癌的在短期内。对于 HBV、HPV16、HPV18 和瘤相关病原 2，病原导入与序列拷贝数的局部变化有关。在 TERT 位点附近的导入与端粒酶的较高表达有关，从而明显激活了该的发育过程。内源性逆转录病原的较高表达与胃癌患者较差的生存期有关。

值得注意出附近：

Zapatka， M.， Borozan， I.， Brewer， D.S. et al. The landscape of viral associations in human cancers. Nat Genet (2020). https：//doi.org/10.1038/s41588-019-0558-9.